Es ist schwierig hier etwas vernünftiges zu finden, die Speicherkarte mit dd zu sichern ist nur OFFLINE möglich und dauert sehr lange.
Ich bin hier auf ein Script gestoßen, das hier automatisch Backups erstellen kann, die man auch wieder auf eine völlig leere SD oder USB zurück spielen kann, diese kann sogar kleiner sein (so lange sich die Datenmenge ausgeht). Es ist also auch ein Bare-Metal-Restore möglich.
Hier gibt es das Script (inkl. Anleitung): https://bangertech.de/raspibackup-einfaches-backup-fuer-den-raspberry-pi/
Ein Backup sollte dabei möglichst auf einen externen Server erfolgen, hier ist NFS dem SMB Protokoll vorzuziehen, da dann auch sehr schnelle Backups mit rsync möglich sind. den Server mountet man am besten mit autofs, so ist sicher gestellt, dass die Verbindung auch bei einem Ausfall des Servers erneut aufgebaut wird.
Hier ein Beispiel, wie man ein Backup auf ein neues (leeres) Medium zurück spielt:
raspiBackup.sh -d /dev/sdf /mnt/backup/rsync/raspberrypi/raspberrypi-rsync-backup-20141230-213032/das Kommando muss als ROOT ausgeführt werden und das Ziel und die Quelle natürlich angepasst werden.